食用菌種質資源庫主要用于收集與保藏種質資源、研究與繁育優質食藥用菌品種，是在微生物所食（藥）用菌研究室、菌種保藏室的基礎上，建立集菌種保藏與供應、數據服務和技術支撐為一體的多功能食用菌種質資源科技平臺，對食藥用菌種質資源保護和利用具有重大意義。它可以確保食用菌種質資源在較長的時間里依然保持良好的特性，同時對于進一步加強食用菌種質資源的保護和利用提供了有力的技術支持。